A primeira aparição do Morty do Mal foi no episódio "Encontros Imediatos", da primeira temporada. Ele aparentava ser apenas o parceiro de um Rick também maligno. Ambos passavam de universo em universo assassinando Ricks e sequestrando Mortys. Contudo, no final do episódio é revelado que o Rick do Mal era apenas um robô sob o controle do Morty do Mal, que é levado para a cidadela dos Ricks sem que ninguém suspeite dele.

O personagem retorna apenas na terceira temporada, no episódio com os contos da Cidadela. A Cidadela está em época de eleição presidencial, uma vez que Rick C-137 matou o Conselho dos Ricks. Entre os vários candidatos Ricks está um candidato Morty, que ganha a eleição para presidente, apesar da desvantagem. Em um novo plot twist, decobre-se que o Presidente Morty é o Morty do Mal. Ele mata os Ricks que mandavam de verdade na Cidadela e instaura seu governo.

A primeira e mais popular teoria entre os fãs da série é a de que o Morty do Mal seria o Morty original do Rick C-137, ambos originados do mesmo universo. Isso quer dizer que o Morty do Rick que acompanhamos em todos os episódios (ou na maioria, pelo menos) não seria o Morty C-137, mas de qualquer outro universo.

Essa teoria diz que Rick estaria presente na vida de Morty desde sua infância, criando o garoto. Isso faria com que Morty se tornasse um adolescente seguro e inteligente. Entretanto, algo teria acontecido, fazendo Rick se separar de seu Morty, o que poderia também ter causado sua depressão e alcoolismo. Rick, sentindo falta de Morty, se muda para uma realidade na qual ele tinha desaparecido por 20 anos e nunca influenciou na criação de Morty.